Le monastère prémontré de Lahonce fut fondé à une date indéterminée, probablement peu après 1150, comme dépendance de Notre-Dame de La Casedieu (Gers). La fondation est attribuée à Bertran, vicomte de Labourd. En 1224, Lui fut donnée le prieuré de Saint-Pierre de Behaune (Lantabat, Pyrénées-Atlantiques), où était entretenu un hôpital pour accueillir et soigner les pèlerins du Chemin de Compostelle.
Au XVIe siècle, après une période de déclin, le monastère fut détruit pendant les guerres de Religion. À cette époque, ses archives furent également perdues, si bien que les informations sur cette maison sont rares. L’établissement demeura très modeste ; au XVIIe siècle, la communauté ne comptait que deux membres, chargés de quelques paroisses, en plus de l’église du monastère elle-même, qui exerçait également des fonctions paroissiales. L'abbaye fut supprimée lors de la Révolution. L'église, édifice des XIIe et XIIIe siècles, conserve ses fonctions paroissiales. D'autres dépendances monastiques ont également été préservées, et l'ensemble a été restauré et rénové depuis 2015. L’espace de l’ancien cloître disparu est aujourd’hui une cour ouverte.
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