Santo Estevo de Atán fue antiguo monasterio del que se tienen pocas noticias. Se ha dicho que fue fundado por el obispo de Lugo Odoario en 747, pero la fuente no es suficientemente fiable. Otra versión sitúa sus inicios en el año 816. En el siglo IX, Alfonso II de Asturias (c. 762-842) lo restauró y dio al obispo Froilán. En un documento considerado falso, fechado en 871, Alfonso III menciona las posesiones de la Iglesia de Lugo, entre ellas, el monasterio de Santo Estevo de Atán.
Por lo que respecta a la iglesia actual, ésta es el resultado de las muchas modificaciones efectuadas en una construcción medieval de mediados del siglo XIII. Se ha considerado que el edificio contenía elementos de época prerrománica, pero tampoco parece que así sea, algunos de estos elementos son de románicos. En cuanto a las portadas, éstas son de origen medieval, pero modificadas, incluso es factible que procedan de otro lugar.
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