La iglesia de Saint-Pierre-le-Puellier debía este nombre a la comunidad de monjas que la había ocupado. Esta casa femenina debía de tener un origen bastante antiguo, posiblemente del siglo VI, aunque no está documentada hasta el año 791, cuando es mencionada por el abad Ithier, fundador de Saint-Paul de Cormery.
Por otro lado, una tradición atribuye la fundación a santa Monégonde († c. 570), quien habría establecido este monasterio cerca de la tumba de san Martín. Según este relato, Monégonde era natural de Chartres, pero, debido a su fama de santidad, se retiró a Tours, donde se recluyó con otras compañeras y formó una comunidad femenina. Otra tradición sitúa la fundación en la misma época, pero en este caso la atribuye a la reina Clotilde (c. 474-c. 545), esposa de Clodoveo I (c. 466-511). Una vez viuda, se habría retirado a Tours, donde habría fundado un monasterio femenino en el que murió en el año 545. Podría tratarse del mismo establecimiento, de dos monasterios diferentes o bien de dos comunidades que se habrían unificado posteriormente, dando lugar a Saint-Pierre-le-Puellier.
El lugar está documentado como monasterio en el año 791, aunque la documentación no permite determinar si entonces se trataba todavía de una comunidad femenina o ya masculina. También se menciona con categoría de abadía en un documento de Roberto II el Piadoso (972-1031), fechado en torno al año 1000. Sin embargo, en la segunda mitad del siglo XII ya figura como un capítulo de canónigos seculares. Hacia el año 1030 se menciona la presencia de clérigos y, en 1080, la iglesia ya consta como parroquia.
En 1119, el papa Calixto II confirmó a los canónigos de Saint-Martin de Tours la posesión de la iglesia parroquial de Saint-Pierre-le-Puellier. Durante el siglo XII, la iglesia fue reconstruida; en 1406 se reformó y, poco después, se construyó el claustro. El conjunto fue ocupado durante las guerras de Religión y, en 1562, se perdieron las reliquias de santa Monégonde. Actualmente, el lugar se encuentra muy transformado, aunque se ha podido excavar su cementerio.
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