Esta abadía fue fundada en 1410 por una bula del papa de Aviñón Benedicto XIII y con la intervención del cercano monasterio de Santa María de Obarenes. Se levantó en el lugar de un antiguo santuario dedicado a la Virgen del Espino, que gozaba de mucha devoción. Inicialmente esta casa era un priorato dependiente de San Millán de la Cogolla, pero en 1442 se independizó de aquella, lo que conllevó diferencias entre los dos centros monásticos. Desde el 1535 tomó el título de abadía, incorporándose a la Congregación de San Benito de Valladolid. El siglo XIX trajo exclaustraciones temporales y ocupaciones de las dependencias monásticas, hasta que en 1835 fue clausurado definitivamente. El lugar pasó a manos particulares y en 1879 a manos de los Misioneros Redentoristas, que todavía lo ocupan.