Saint-Martin-des-Champs tiene su origen en una iglesia de época merovingia dedicada a san Martín de Tours, de la que se han encontrado restos arqueológicos que confirman su existencia. Se conoce la existencia en la ciudad de París de una iglesia anterior dedicada a san Martín, que quedó afectada por un incendio en 585, seguramente sería una capilla que estaba situada en otro lugar. No es hasta el 710 que se tiene constancia documental de la iglesia de Saint-Martin, que figura mencionada en un diploma del rey Childeberto III, esta iglesia merovingia quedó destruida a causa de las invasiones de los vikingos. Ya en el siglo XI, Enrique I hizo levantar en el mismo lugar una nueva iglesia donde fundó una canónica agustiniana, ésta fue fundada hacia el 1059-60, la iglesia se consagró en 1067.

Saint-Martin-des-Champs
Detalle del Plan de Paris (Michel E. Turgot, 1734-39)
Bibliothèque nationale de France

Saint-Martin-des-Champs
El refectorio, actualmente biblioteca

El 1079 el rey Felipe I entregó aquella canónica y sus posesiones al abad de Cluny Hugo de Semur, convirtiéndola en un priorato suyo, la casa fue considerada una de las "cinco hijas de Cluny". Los bienes y las extensas posesiones de este priorato fueron confirmados por una bula otorgada por el papa Urbano II el 1096. La primera mitad del siglo XII fue época de importantes obras de construcción que afectaron diferentes dependencias del monasterio especialmente la iglesia y la fortificación del conjunto. El siglo XIII vio levantar nuevas construcciones, capillas, el claustro y el refectorio que aún se conserva, obras ya góticas. A partir del 1471 el monasterio pasó a estar gobernado por priores comendatarios. Entre otros, dependía de este lugar el priorato de Saint-Denis de la Chartre.
 

Saint-Martin-des-Champs
Interior del refectorio convertido en biblioteca
Grabado de Gérald (sin fecha)
Collection BIU Santé Médecine

Enrique I fundando la iglesia de Saint-Martin
Detalle de un manuscrito iluminado (1225-1275)
Bibliothèque nationale de France

Después de una larga época de decadencia a mediados del siglo XVII, a principios del siglo siguiente se llevaron a cabo nuevos trabajos de construcción, para adecuar y modernizar las antiguas estructuras. Entre el años 1790-91 y debido a la Revolución, la casa monástica fue suprimida definitivamente. Poco después se convirtió en la sede del Conservatoire des arts et métiers y ahora acoge el Museo de artes te métiers, dependiendo del anterior.
 

Saint-Martin-des-Champs (c1790)
Bibliothèque nationale de France

Saint-Martin-des-Champs
Fachada de la iglesia