La fundación de este monasterio fue impulsada por Ponce de Minerva (?-1175), su esposa Estefanía Ramírez (?-1183) e hijos, que en 1167 pusieron a disposición de los monjes cistercienses de La Santa Espina (Valladolid) unas propiedades en Sandoval, además de otros bienes. Posteriormente, los propios fundadores también participaron en la fundación del cercano monasterio femenino de Carrizo (León).
El fundador era una personalidad notable de la corte de Alfonso VII de León (posiblemente originario del Minervois, Languedoc), en 1142 había recibido del rey aquellas propiedades que ahora cedía a los cistercienses. En 1171 la nueva comunidad ya estaba en funcionamiento y rápidamente se convirtió en un centro pujante, durante muchos años se benefició de numerosas donaciones de procedencia real y de miembros de la nobleza.
Después de un largo período de prosperidad, entre los siglos XIV y XV pasaba por una época de decadencia y en 1486 se afilió a la Congregación de Castilla. En los años 1592 y 1615, el monasterio fue víctima de unos incendios que dejaron el monasterio, salvo la iglesia, muy dañado, incluso hizo peligrar su existencia por el intento de traslado de la comunidad a León, lo que no llegó a hacerse efectivo. Tuvo actividad hasta la desamortización (1835), entonces cayó en el abandono y ruina. Aún espera la restauración definitiva.
Filiación de Sandoval
Según el Originum Cisterciensium (L. Janauschek, 1877)- ÁLVAREZ FERNÁNDEZ, Francisco José (1997). Santa María de Sandoval en su etapa final. Cistercium, núm. 208
- ÁLVAREZ OBLANCA , Wenceslao (1984). Documentos procedentes del Monasterio de Sandoval (I). Tierras de León, núm. 24
- CARRERO, Eduardo (2002). El monasterio leonés de Santa María de Sandoval y la iconografía de San Bernardo ante el Crucificado y Jesús Niño. De arte, núm. 1
- CASADO, Concha; i altres (2000). Los monasterios de Santa María de Carrizo y Santa María de Sandoval. Lleó: Lancia
- COCHERIL, Maur (1974). La llegada de los monjes blancos a España y la fundación del Monasterio de Sandoval. Tierras de León, núm. 19
- FERRERO, Víctor; i altres (1997). El Monasterio de Sandoval: 150 años de abandono. Pro Monumenta
- GARCÍA GUINEA, Miguel Ángel; dir. (2002). Enciclopedia del Románico en Castilla y León. León. Aguilar de Campoo: Fundación Santa María la Real
- JANAUSCHEK, Leopoldus (1877). Originum Cisterciensium. Vol. 1. Viena
- MANRIQUE, Angel (1642). Cisterciensium Annalium, Vol. 2. Lió: L. Anisson
- RISCO, Fray Manuel (1786). España Sagrada, tomo 35. Madrid: Marín
- YÁÑEZ NEIRA, Damián (1971). El monasterio de Sandoval (1171-1971). Tierras de León, núm. 11
- YEPES, Antonio de (reed. 1960). Crónica General de la Orden de San Benito. Vol. III. Madrid: Atlas