La fundació d’aquest monestir fou impulsada per Ponce de Minerva (?-1175), la seva esposa Estefanía Ramírez (?-1183) i fills, que el 1167 van posar a disposició dels monjos cistercencs de La Santa Espina (Valladolid) unes propietats a Sandoval, a més d’altres béns. Posteriorment, els mateixos fundadors també van participar en la fundació del proper monestir femení de Carrizo (Lleó).
El fundador era una personalitat notable de la cort d’Alfons VII de Lleó (possiblement originari del Menerbès, Llenguadoc), el 1142 havia rebut del rei aquelles propietats que ara cedia als cistercencs. El 1171 la nova comunitat ja era en funcionament i ràpidament va esdevenir un centre puixant, durant molts anys es va beneficiar de nombroses donacions de procedència reial i de membres de la noblesa.
Després d’un llarg període de prosperitat, entre els segles XIV i XV passava per una època de decadència i el 1486 es va afiliar a la Congregació de Castella. En els anys 1592 i 1615, el monestir fou víctima d’uns incendis que van deixar el monestir, tret de l’església, força malmès, fins i tot va fer perillar la seva existència per l’intent de trasllat de la comunitat a Lleó, cosa que no es va arribar a fer efectiu. Va tenir activitat fins a la desamortització (1835), llavors va caure en l’abandó i ruïna. Encara espera la restauració definitiva.
Filiació de Sandoval
Segons l'Originum Cisterciensium (L. Janauschek, 1877)- ÁLVAREZ FERNÁNDEZ, Francisco José (1997). Santa María de Sandoval en su etapa final. Cistercium, núm. 208
- ÁLVAREZ OBLANCA , Wenceslao (1984). Documentos procedentes del Monasterio de Sandoval (I). Tierras de León, núm. 24
- CARRERO, Eduardo (2002). El monasterio leonés de Santa María de Sandoval y la iconografía de San Bernardo ante el Crucificado y Jesús Niño. De arte, núm. 1
- CASADO, Concha; i altres (2000). Los monasterios de Santa María de Carrizo y Santa María de Sandoval. Lleó: Lancia
- COCHERIL, Maur (1974). La llegada de los monjes blancos a España y la fundación del Monasterio de Sandoval. Tierras de León, núm. 19
- FERRERO, Víctor; i altres (1997). El Monasterio de Sandoval: 150 años de abandono. Pro Monumenta
- GARCÍA GUINEA, Miguel Ángel; dir. (2002). Enciclopedia del Románico en Castilla y León. León. Aguilar de Campoo: Fundación Santa María la Real
- JANAUSCHEK, Leopoldus (1877). Originum Cisterciensium. Vol. 1. Viena
- MANRIQUE, Angel (1642). Cisterciensium Annalium, Vol. 2. Lió: L. Anisson
- RISCO, Fray Manuel (1786). España Sagrada, tomo 35. Madrid: Marín
- YÁÑEZ NEIRA, Damián (1971). El monasterio de Sandoval (1171-1971). Tierras de León, núm. 11
- YEPES, Antonio de (reed. 1960). Crónica General de la Orden de San Benito. Vol. III. Madrid: Atlas