Tradicionalment s’admet que la fundació d’aquesta casa va ser inspirada pel mateix sant Francesc en la seva visita a la ciutat i al sepulcre de l’apòstol. Segons això, el seu fundador fou Cotolay, a qui el sant es va dirigir per encarregar-li l’empresa fundacional, amb la seva intervenció miraculosa per finançar l’obra. El primer convent es va aixecar en el segle XIII però va caure en ruïna el 1700 i es va refer de nou entre els anys 1742 i 1770.