En 1149, una vez conquistada la ciudad de Lleida, el conde Ramon Berenguer IV organizó este territorio y entre otras muchas actuaciones, impulsó la creación de una canónica agustiniana dependiente de San Rufo de Aviñón. En 1152 cedió estas tierras, donde se levantaría el establecimiento monástico, y un palacio situado en la ciudad.
Esta donación fue confirmada posteriormente tanto por el obispo de Lleida como por el propio Ramon Berenguer IV, esta última confirmación hacía referencia a las casas que los canónigos de Aviñón tenían en Catalunya: Santa Maria de Terrassa, Santa Maria de Besalú y ésta de Lleida. Siguió un período de mucha prosperidad, conseguida gracias a las importantes donaciones recibidas, pero en el siglo XV se encontraba en decadencia y en 1418 murió el último canónigo que lo ocupaba, sin que la comunidad hubiera logrado terminar el conjunto monástico proyectado. El lugar pasó a manos del obispado, pero quedó en el abandono. En 1582 Sant Ruf de Lleida fue ocupado transitoriamente por la cartuja de Araceli, fundada en este lugar desde Escaladei y que más adelante se trasladaría a Butsènit. Los considerables restos de la iglesia románica han sido empleados para usos agrícolas, en 2019 fueron declarados como bien cultural de interés nacional.
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